Struktura organizacyjna Wojskowej Komendy Uzupełnień Warszawa-Praga:
Kierownictwo
Wydział Rekrutacji
Wydział Planowania Mobilizacyjnego i Administrowania Rezerwami
Pion Ochrony Informacji Niejawnych
Wojskowa Komenda Uzupełnień Warszawa - Praga jest w strukturach Ministerstwa Obrony Narodowej i bezpośrednio podlega Wojewódzkiemu Sztabowi Wojskowemu w Warszawie, który służbowo podlega pod Szefa Sztabu Generalnego Wojska Polskiego.